Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNHIT3Q15649 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNHIT3Q15649 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNHIT3Q15649 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNHIT3Q15649 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNHIT3Q15649 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNHIT3Q15649 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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ZNHIT3Q15649 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ZNHIT3Q15649 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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