Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PTPRKQ15262 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PTPRKQ15262 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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