Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

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Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EEA1Q15075 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
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