Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SEMA3AQ14563 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms