Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
EBI3Q14213 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms