Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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DDX39BQ13838 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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DDX39BQ13838 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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DDX39BQ13838 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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DDX39BQ13838 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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DDX39BQ13838 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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DDX39BQ13838 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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DDX39BQ13838 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DDX39BQ13838 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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