Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKP1Q13835 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms