Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CACNA1SQ13698 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNA1SQ13698 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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