Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MTMR3Q13615 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MTMR3Q13615 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms