Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ITGB3BPQ13352 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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ITGB3BPQ13352 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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ITGB3BPQ13352 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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ITGB3BPQ13352 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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ITGB3BPQ13352 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ITGB3BPQ13352 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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