Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CALCOCO2Q13137 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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CALCOCO2Q13137 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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CALCOCO2Q13137 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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CALCOCO2Q13137 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
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CALCOCO2Q13137 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CALCOCO2Q13137 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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