Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAF1Q13077 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms