Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HSPB3Q12988 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HSPB3Q12988 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
HSPB3Q12988 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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