Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PTPRJQ12913 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PTPRJQ12913 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
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