Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NFIAQ12857 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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