Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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RAB40BQ12829 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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RAB40BQ12829 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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RAB40BQ12829 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
RAB40BQ12829 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
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