Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SLFN5Q08AF3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms