Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PDE4DQ08499 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PDE4DQ08499 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms