Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTDSPL2Q05D32 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CTDSPL2Q05D32 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms