Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CHRNEQ04844 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms