Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GBE1Q04446 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms