Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E2F1Q01094 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms