Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZBED6P86452 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZBED6P86452 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZBED6P86452 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZBED6P86452 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms