Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERVK-21P61565 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms