Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MCCD1P59942 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MCCD1P59942 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms