Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CLDN2P57739 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms