Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLE2P56282 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLE2P56282 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms