Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SH3BGRP55822 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SH3BGRP55822 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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