Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CASP9P55211 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CASP9P55211 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CASP9P55211 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms