Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TTPAP49638 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217 ms