Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NESP48681 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NESP48681 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NESP48681 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NESP48681 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NESP48681 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NESP48681 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
NESP48681 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NESP48681 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NESP48681 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NESP48681 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NESP48681 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NESP48681 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NESP48681 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NESP48681 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NESP48681 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NESP48681 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NESP48681 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms