Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GJC1P36383 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GJC1P36383 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GJC1P36383 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GJC1P36383 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms