Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PCSK1P29120 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms