Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB2P29033 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB2P29033 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB2P29033 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GJB2P29033 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GJB2P29033 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB2P29033 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB2P29033 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms