Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SSFA2P28290 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SSFA2P28290 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms