Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PSMB9P28065 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PSMB9P28065 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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