Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VAMP1P23763 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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