Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PTGS1P23219 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms