Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
HOXA5P20719 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms