Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TFE3P19532 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFE3P19532 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFE3P19532 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFE3P19532 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFE3P19532 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFE3P19532 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFE3P19532 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TFE3P19532 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TFE3P19532 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TFE3P19532 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFE3P19532 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TFE3P19532 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms