Protein–RNA interactions for Protein: P18206

VCL, Vinculin, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCLP18206 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VCLP18206 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VCLP18206 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VCLP18206 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms