Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CTPS1P17812 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS1P17812 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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