Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EPCAMP16422 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms