Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFTRP13569 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFTRP13569 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFTRP13569 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFTRP13569 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFTRP13569 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFTRP13569 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CFTRP13569 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFTRP13569 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFTRP13569 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFTRP13569 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFTRP13569 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFTRP13569 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFTRP13569 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFTRP13569 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFTRP13569 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFTRP13569 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFTRP13569 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CFTRP13569 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms