Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
BMP3P12645 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
BMP3P12645 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms