Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ITGAMP11215 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ITGAMP11215 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.3 ms