Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
TMEM225BP0DP42 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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