Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GJB1P08034 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms