Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PRM2P04554 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PRM2P04554 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms