Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NIPSNAP2O75323 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms